Mamy przyjemność poinformować, że Zakład Mikrobiologii Rolniczej reprezentowany przez dr Annę Marzec-Grządziel został członkiem konsorcjum w konkursie One Health interventions to prevent or reduce the development and transmission of AMR, organizowanym przez sieć JPIAMR.
Tytuł projektu: Specific Targeting of Antimicrobial Resistant Strains in situ using Targeted-Antibacterial-Plasmids
Tytuł projektu w języku polskim: Specyficzne zwalczanie szczepów opornych na środki przeciwdrobnoustrojowe in situ przy użyciu plazmidów antybakteryjnych o ukierunkowanym działaniu
Akronim: STARS-TAP
Skład konsorcjum:
- Christian Lesterlin, Centre National de la Recherche Scientifique, Francja (Koordynator);
- Pierre Bogaerts, UCL – Université Catholique de Louvain, Belgia;
- Gregory Jubelin, French National Research Institute for Agriculture, Food and Environment, Francja;
- Anna Marzec-Grzadziel, Institute of Soil Science and Plant Cultivation – State Research Institute, Poland;
- William Couet, French National Institute of Health and Medical Research, Francja.
Informacje o projekcie: https://www.jpiamr.eu/projects/stars-tap/
Aby rozwiązać problem oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe (AMR), który jest głównym problemem na całym świecie, potrzebne są programy badawcze w dziedzinie zdrowia. Innowacyjna strategia STARS-TAP opiera się na plazmidach TAP (Targeted-Antibacterial-Plasmids),
które wykorzystują koniugację DNA w celu dostarczenia systemów CRISPR/Cas wywierających aktywność antybakteryjną na specyficznie ukierunkowane szczepy AMR. In vitro wykazano,
że TAPs mogą selektywnie zabijać szczepy AMR poprzez celowanie w chromosom lub przywracać wrażliwość szczepów AMR poprzez celowanie w plazmidy lekooporności, bez wpływu na inne niecelowane szczepy obecne w populacji bakterii. Przełożenie tych badań przeprowadzonych
w warunkach in vitro na różne środowiska in situ miałoby niewątpliwie rzeczywisty wpływ, otwierając nowe możliwości interwencji w celu wyeliminowania szczepów AMR. W tym celu, opracujemy bibliotekę TAPs skierowanych przeciwko wielu klinicznie i środowiskowo istotnym szczepom AMR lub przeciwko specyficznym genom AMR nadającym oporność na beta-laktamy (głównie karbapenemy). Ocenimy zdolność TAPs do specyficznej eliminacji szczepów AMR
ze ścieków szpitalnych lub z mikrobioty jelitowej zwierząt. Zajmiemy się również rozprzestrzenianiem się TAPs i ich zdolnością do eliminacji szczepów AMR w glebie środowiskowej oraz ryzosferze roślin. Ta niezbadana i wszechstronna strategia antybakteryjna może być obiecującym podejściem uzupełniającym antybiotyki, w terapii oraz profilaktyce ludzi i zwierząt zakażonych lub skolonizowanych szczepami AMR, a nawet w celu uniknięcia rozprzestrzeniania się AMR w zantropogenizowanych zbiornikach środowiskowych, takich jak gleby rolnicze i ścieki.
Zakład Mikrobiologii odpowiedzialny jest za izolację DNA/ RNA oraz analizę funkcjonalną mikroorganizmów obecnych w glebie. DNA poddane będzie analizie sekwencjonowania 16S rRNA w celu określenia składu mikroorganizmów. RNA posłuży do sekwencjonowania w celu wykrycia poziomu ekspresji genów.
Opis projektu (ENG)
The global spread of antimicrobial resistance (AMR) among pathogenic bacteria is recognized as one of the biggest concerns in public health and a research priority in microbiology.
Drug-resistance increases exponentially for certain bacterial organisms and is becoming the main threat to human health worldwide. As a consequence, national and international authorities have emphasized the need to taking a broad, coordinated approach to develop new antimicrobial strategies to fight against drug-resistant bacteria across multiple sectors such as human health and animal health, agriculture and environment1 (i.e. ‘One health’ major challenge).
The STARS-TAP research program aims at developing an innovative non-antibiotic antibacterial methodology to specifically target AMR strains from natural bacterial communities in several ecosystems in situ. The proposed methodology is based on Targeted-Antibacterial-Plasmids (TAPs) that use DNA conjugation to deliver CRISPR/Cas systems exerting a strain-specific antibacterial activity. If successful, our research would represent a real breakthrough for clinical and environmental microbiology, and open new options for the elimination of AMR strains from various ecosystems. This unexplored and versatile strategy complementary to antibiotic treatments holds the potential to be used for preventive decolonization purposes, or even in agriculture to tackle AMR prevalence in amended soils.